水處理中用作凈水劑、殺箘劑、清潔劑。城市污水深度處理還會用到脫色劑、次氯酸鈉等。染料工業用于制造硫化寶藍。使處理后的污水優于國家排放規范，達到中水回用。

次氯酸鈉在水中可以水解出少量的次氯酸和氫氧化鈉。在水中不穩定，本身具有比較強的氧化性，容易與其他物質發生反應被消耗掉。

氯氣、漂白粉（含次氯酸鈣）以及次氯酸鈉漂白性之時，一般強調起漂白作用的是次氯酸。漂白性主要是看氧化劑或者還原劑是否有破壞某些有機物發色基團的能力，使之不再顯示特定顏色的一個性質。

次氯酸鈉是強氧化劑和清潔劑，它是通過取源于廣泛價廉的食用鹽或海水稀溶液，經無隔膜電解而發生的。它與氯和氯的化合物相比，具有相同的氧化性和清潔作用。

次氯酸鈉在水中除了殺死細箘和微生物以外不會與其他化學物質發生化學反應，不會像液氯投加那樣產生對人體有害的致癌物質。經環保組織與衛生防疫部分檢測及全國近百家用戶運用，特別合適各種廢(污)水處理和微污染處理。

并且偏堿性的次氯酸鈉還能夠起到中和水質的作用，因此更受現代化水處理廠的歡迎。

由于次氯酸鈉容易因陽光、溫度的作用而分解，一般就地制備后需立即投加。通常其消耗比使用漂白粉清潔還要低。

次氯酸鈉固體或溶液都不宜久存，而且肯定要在避光低溫環境下存放。

依據不同水量、不同水質主動投加生化劑、凈化劑、清潔劑，會大大進步處理作用、下降處理成本。

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